2012/13シーズン

2012/13シーズン
リーグ戦25試合出場0得点

　開幕からスタメン出場を続けていた長友だが、ミラノダービーではハンドを含む2度の警告を受けて退場となってしまった。2013年、再びやってきたミラン戦では意地の1アシストを記録するも負傷してしまう。

　その後、戦列復帰を果たしたが、その初戦となった第32節・カリアリ戦でアクシデントが起こる。67分から途中出場した日本代表だったが、わずか8分後に負傷。翌日、クラブから左膝半月板損傷と発表された。長友は手術を回避し保存療法を選択している。